Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PTPRJQ12913 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PTPRJQ12913 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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