Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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