Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms