Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms