Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms