Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms