Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms