Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms