Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN2Q02246 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms