Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms