Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTRA4P83105 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms