Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBP5P82980 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBP5P82980 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBP5P82980 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBP5P82980 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBP5P82980 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms