Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMF1P82094 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMF1P82094 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms