Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms