Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP98P52948 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP98P52948 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms