Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF135P52742 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms