Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms