Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms