Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms