Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms