Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms