Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALDH4A1P30038 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms