Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms