Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VARSP26640 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VARSP26640 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VARSP26640 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms