Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms