Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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