Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOP08100 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOP08100 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOP08100 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms