Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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