Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UPP2O95045 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPP2O95045 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPP2O95045 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPP2O95045 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UPP2O95045 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPP2O95045 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms