Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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