Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB3O75712 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJB3O75712 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB3O75712 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms