Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR5O60602 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR5O60602 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms