Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms