Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms