Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms