Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms