Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms