Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG3Q9Y2Y8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms