Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCDH10Q9P2E7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms