Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
USP36Q9P275 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP36Q9P275 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
USP36Q9P275 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
USP36Q9P275 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms