Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms