Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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