Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A8Q9C0K1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms