Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIOK2Q9BVS4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms