Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDC6Q99741 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms