Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNAQ96QF7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms