Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGAP1Q96PV0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms