Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C9orf85Q96MD7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms