Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms