Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms